Diferente do primeiro turno, o presidente Lula conseguiu êxito em Aracaju no segundo turno. Na capital, o petista recebeu 56,64% dos votos válidos superando o tucano Geraldo Ackmin que teve 43,36%.
O resultado no Estado de Sergipe foi na mesma proporção. Lula teve 60,16% e Alckmin 39,84%. Votos nulos e brancos foram respectivamente: 35.102 (3,30%) e 12.652 (1,19%). O número de abstenções atingiu 235.797 (18,14%).
Historicamente a capital elege candidatos de esquerda, mas assustou um pouco os petistas quando deu maioria ao tucano no primeiro turno.